Praca z mikroskopem umożliwia dostrzeżenie szczegółów niewidocznych podczas tradycyjnego leczenia endodontycznego np. nietypowe ujścia kanałowe, kanały rozwidlające się, dodatkowe, boczne.
Możliwe jest wizualne zlokalizowanie i usunięcie złamanych narzędzi kanałowych oraz dalsze precyzyjne opracowanie i wypełnienie systemu kanałowego. W nowoczesnej endodoncji, wysokiej jakości leczenie bez kontroli mikroskopu jest już niemożliwe.